分子进化中DNA序列自比对浓度的无序与幂律尾
种群与进化
2014-12-23 v3 生物物理
基因组学
摘要
自比对浓度作为多种物种基因组中完全相同匹配最大片段长度的函数,通常呈现延伸至最大尺度的幂律尾,即,具有相似或明显不同的负值()。分子进化的相关基本过程是片段重复和点突变,最近棒碎裂现象学已被用于解释中性进化。然而,无序是进化系统的固有属性,通过将其在时间上冻结(淬火)以建立一个简单的碎裂模型,我们得到了衰减、稳态以及一般的全时依赖解,当时均,这与纯模型(无无序)仅在时的唯一幂律解形成对比。其他代数项可能在中间尺度占主导,这似乎得到某些物种(如水稻)的证实。我们还展示了显示不止一个标度区间的自比对结果,这与存在不止一个在不同区间占主导的代数项的理论结果一致。
引用
@article{arxiv.1411.5624,
title = {Disorder and Power-law Tails of DNA Sequence Self-Alignment Concentrations in Molecular Evolution},
author = {Kun Gao and HongGuang Sun and Jian-Zhou Zhu},
journal= {arXiv preprint arXiv:1411.5624},
year = {2014}
}
备注
a figure for the introductory discussion removed; less lengthy