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任意突变率下 Luria-Delbrück 模型中的临界性

生物物理 2024-02-22 v1 种群与进化

摘要

Luria-Delbrück 模型是一个具有随机突变的种群动力学经典模型,历史上曾被用于证明随机突变驱动进化。在典型场景中,相关突变率极小,且仅在最终时间点计数突变体。在此,受近期 DNA 修复实验的启发,我们研究了一个在形式上等同于 Luria-Delbrück 设置的数学模型,其中修复率 pp 扮演突变率的角色,但取值较大,约为每次细胞分裂一个量级。我们发现,尽管在大时间极限下修复细胞的比例趋近于 1,但修复细胞数量的方差会经历相变:当 p>1/2p>1/2 时,方差随时间减小;然而有趣的是,当 p<1/2p<1/2 时,尽管修复细胞的比例趋近于 1,修复细胞数量的方差却随时间增加。通过分析 DNA 修复实验,我们发现为了解释数据,该模型还应考虑一旦启动修复过程后成功修复的概率。综上所述,我们的工作展示了可变性研究如何导致意想不到的相变,并为 DNA 修复过程提供生物学见解。

关键词

引用

@article{arxiv.2402.13339,
  title  = {Criticality in the Luria-Delbr\"uck model with an arbitrary mutation rate},
  author = {Deng Pan and Jie Lin and Ariel Amir},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2402.13339},
  year   = {2024}
}

备注

5 pages, 4 figures