强制聚合物穿隧计算方法的批判性评估
生物物理
2009-11-13 v3 计算物理
摘要
在强制聚合物穿隧中，平均穿隧时间 τ 随孔道力 f 和聚合物长度 N 的标度关系为 τ ∼ f⁻¹ N^β。我们证明，Metropolis 蒙特卡洛方法中导致大力下力标度关系破裂的伪影，可能是不同计算结果之间以及计算结果与实验结果之间一些争议的原因。利用朗之万动力学模拟，我们表明标度指数 β ≤ 1 + ν 并非普适的，而是依赖于 f。此外，我们证明强制穿隧可以由一个相对简单的力平衡论证来描述，且 β 仅源于聚合物的初始构型。
引用
@article{arxiv.0806.3178,
title = {Critical evaluation of the computational methods used in the forced polymer translocation},
author = {V. V. Lehtola and R. P. Linna and K. Kaski},
journal= {arXiv preprint arXiv:0806.3178},
year = {2009}
}