用于线性化 Poisson-Boltzmann 方程的修正梯形法则-IBIM

在本文中，我们求解用于模拟溶剂中大分子电势的线性化 Poisson-Boltzmann 方程。我们推导了一种精度提升的修正梯形法则，用于该方程的边界积分公式。更具体地，与典型的边界积分公式不同，修正梯形法则应用于在 $\mathbb{R}^3$ 中使用均匀笛卡尔网格积分一组紧支撑奇异积分系统，而无需显式的曲面参数化。采用由快速多极子方法加速的 Krylov 方法求逆所得线性系统。我们研究了所提方法的效能，并将其与现有的低阶方法进行比较。随后我们将该方法应用于浸没在溶剂中的大分子静电势计算。由通用方法定义的溶剂排除表面仅是分段光滑的，我们研究了该方法对此类表面的有效性。