细胞群体的约束建模与仿真
定量方法
2016-07-18 v1 组织与器官
摘要
肿瘤内异质性已被认为是损害癌症治疗效果的癌细胞特征。本文提出了一种约束建模方法的扩展，旨在模拟细胞群体的代谢，以提供对这些系统更完整的表征，特别关注其各组分之间的关系。我们使用一个玩具模型并考虑癌症代谢重连涉及的主要代谢途径来测试该方法。该玩具模型被用作个体，以构建一个由多个相互作用的个体组成的群体模型，这些个体均具有相同的拓扑和化学计量，并共享相同的营养供应。我们观察到，在我们的群体中，癌细胞相互合作以达到共同目标，但未必具有相同的代谢特征。我们还注意到，从群体模型中涌现出的异质性源于个体成员的目标与整个群体的目标之间的不匹配。
引用
@article{arxiv.1607.04463,
title = {Constraint-based modeling and simulation of cell populations},
author = {M. Di Filippo and C. Damiani and R. Colombo and D. Pescini and G. Mauri},
journal= {arXiv preprint arXiv:1607.04463},
year = {2016}
}