偏倚采样条件下传染病动态传播的置信度评估
种群与进化
2020-07-30 v2 物理与社会
摘要
在传染病(如 2020 年 COVID-19 疫情)传播过程中,对采样数据的解释在政策应对中起着关键作用。然而,由于现实世界条件的复杂性以及诊断试剂可得性的限制(使得检测必然偏向有症状个体),这是一项不平凡的工作。为了得出准确结论,必须深入理解采样置信度与偏倚。在本稿件中,我们提供了一个用于评估疾病指标(如趋势检测、峰值检测和疾病传播估计)置信度的采样随机模型。我们的模型在已知动态的传染病中模拟疾病检测,使我们能够使用蒙特卡洛采样来评估指标置信度。该模型可提供真实的模拟数据,用于数据分析与预测方法的设计和校准。作为示例,我们使用该方法表明,每天使用少于 份偏倚样本即可识别疾病趋势,而每天额外使用 份无偏样本可估计疾病传播情况。我们还证明,通过求取动态峰值查找策略的精确率与召回率,该模型可用于评估更先进的指标。
引用
@article{arxiv.2006.02961,
title = {Confidence in the dynamic spread of epidemics under biased sampling conditions},
author = {James D. Brunner and Nicholas Chia},
journal= {arXiv preprint arXiv:2006.02961},
year = {2020}
}
备注
11 figures, 2 tables, 15 pages