microRNA簇通过现有转录本中的新发夹结构产生

遗传连锁可能导致在单个启动子的控制下，从多顺反子转录本中表达多个产物。在动物中，蛋白质编码的多顺反子转录本很少见。然而，microRNA在动物基因组中经常成簇，这些簇通常作为单个单位被转录。microRNA簇的演化一直是许多推测的主题，通常认为功能相关的microRNA簇具有选择优势。然而，迄今为止尚未探索microRNA簇的起源。在此我们研究了黑腹果蝇中microRNA簇的演化。我们观察到，大多数microRNA簇是通过在现有microRNA转录本中新形成类microRNA发夹结构而产生的。一些簇也通过单个microRNA的串联重复产生。比较基因组学表明，这些簇不太可能分裂或发生重排。我们没有发现任何通过预先存在的microRNA基因重排产生簇的实例。我们提出了一个microRNA簇演化模型，其中对簇中某一个microRNA的选择会干扰其他连锁microRNA的演化。我们的分析表明，对microRNA和小RNA的研究必须考虑连锁关联。