DNA 二聚体、三聚体及聚合物中的电荷转移
生物物理
2014-07-01 v2 生物大分子
摘要
本文在碱基对层面描述了电子和空穴沿 DNA 二聚体、三聚体及聚合物的转移过程,使用了相关的碱基对位点能量和连续碱基对之间的跳跃参数。通过求解一个包含 个耦合微分方程的方程组,确定了载流子沿长度为 个碱基对的 DNA 片段的时空演化。计算了有用的物理量,包括纯平均载流子转移速率 、用于转移速率随电荷转移距离 3.4 {\AA} 变化的指数拟合 () 的逆衰减长度 ,以及用于转移速率随单体数量 变化的幂律拟合 () 的指数 。除其他外,还研究了沿聚合物 poly(dG)-poly(dC)、poly(dA)-poly(dT)、GCGCGC...、ATATAT... 的电子和空穴转移。 () 落在 0.2 - 2 {\AA} (1.7 - 17) 范围内, () 通常约为 - (-) PHz,尽管一般而言落在更宽的 -10 (-) PHz 范围内。将结果与过去的预测和实验进行了比较。我们的方法阐明了特定 DNA 片段在多大程度上可以作为电荷转移的有效介质。
引用
@article{arxiv.1312.6842,
title = {Charge transfer along DNA dimers, trimers and polymers},
author = {Constantinos Simserides},
journal= {arXiv preprint arXiv:1312.6842},
year = {2014}
}
备注
7 pages, 4 figures, 4 tables, the "supporting material mentioned in v1" was already integrated with main text