通过二核苷酸间距表征作为生物复杂性函数的DNA甲基化
定量方法
2016-04-27 v1 生物物理
基因组学
应用统计
摘要
我们对若干不同复杂性生物 DNA 序列中给定二核苷酸连续出现之间的距离进行了统计研究。我们的分析突出了哺乳动物 DNA 中二核苷酸 CG 分布的独特特征，指向该二核苷酸在 DNA 甲基化中的作用。尽管哺乳动物的 CG 分布表现出具有可比参数的指数尾，但其他研究生物（例如鱼、昆虫、细菌和病毒）的情况更为异质，可能是因为这些生物中 DNA 甲基化具有不同功能角色。我们的分析表明，二核苷酸 CG 间距的分布为根据甲基化功能表征和分类生物提供了有用见解。
引用
@article{arxiv.1511.08445,
title = {Characterization of DNA methylation as a function of biological complexity via dinucleotide inter-distances},
author = {Giulia Paci and Giampaolo Cristadoro and Barbara Monti and Marco Lenci and Mirko Degli Esposti and Gastone C. Castellani and Daniel Remondini},
journal= {arXiv preprint arXiv:1511.08445},
year = {2016}
}
备注
13 pages, 5 figures. To be published in the Philosophical Transactions A theme issue "DNA as information"