细胞类型特异性计算神经解剖学：基于矢状与冠状艾伦脑图谱的模拟
神经元与认知
2015-05-26 v1
摘要
成年小鼠大脑的艾伦图谱（Allen Atlas）是一个全脑范围、全基因组的数据集，已在线提供，引发了神经解剖学的复兴。特别是，它已被用于以计算、数据驱动的方式定义脑区，并估算由转录活性独立表征的细胞类型的区域特异性。然而，这些结果基于每个基因一系列共配准（冠状面）ISH图像序列，而在线ABA包含每个基因的多个图像序列，包括矢状面的。由于矢状面序列主要覆盖左半球，我们可以通过为每个基因重复抽取随机图像序列并将计算限制在左半球来模拟结果的变异性。这给出了计算神经解剖学结果上误差条的估计。
引用
@article{arxiv.1505.06434,
title = {Cell-type-specific computational neuroanatomy, simulations from the sagittal and coronal Allen Brain Atlas},
author = {Pascal Grange},
journal= {arXiv preprint arXiv:1505.06434},
year = {2015}
}
备注
prepared for the International Conference on Mathematical Modeling in Physical Sciences June 5-8, 2015, Mykonos Island, Greece