可扩展脑图谱:即时基于 Web 访问公共脑图谱及相关内容
神经元与认知
2014-12-12 v2
摘要
可扩展脑图谱 (SBA) 是一组 Web 服务,提供对不同物种的大量脑图谱模板的统一访问。其主要组件是一个图谱查看器,以切片堆栈的形式显示脑图谱数据,用户可在其中选择立体定位坐标和脑区。随后,这些选择被用于启动需要坐标或区域名称作为输入的 Web 查询。它支持在查看器内运行的插件,当选择新的切片、坐标或区域时做出响应。它包含六个物种的 20 个图谱模板,以及用于计算坐标变换、显示解剖连通性和基准点、并检索脑区属性、描述、定义和 3D 重建的插件。SBA 的目标是直接在 Web 浏览器中提供所有公开可用脑图谱的统一表示,同时保持作为一个专注于图谱比较、搜索、坐标变换和交互式显示的响应迅速且轻量级的资源。
引用
@article{arxiv.1312.6310,
title = {The Scalable Brain Atlas: instant web-based access to public brain atlases and related content},
author = {Rembrandt Bakker and Paul Tiesinga and Rolf Kötter},
journal= {arXiv preprint arXiv:1312.6310},
year = {2014}
}
备注
Rolf K\"otter sadly passed away on June 9th, 2010. He co-initiated this project and played a crucial role in the design and quality assurance of the Scalable Brain Atlas