主动图谱：结合三维解剖模型与纹理检测器
计算机视觉与模式识别
2018-01-30 v3 神经元与认知
定量方法
摘要
尽管功能磁共振成像（fMRI）等现代成像技术为在体研究大脑开辟了令人兴奋的新可能，组织学切片仍然是研究单神经元水平大脑解剖结构的最佳方式。自1909年以来，组织学图谱变化甚微，定位脑区仍是一项劳动密集型过程，仅由经验丰富的神经解剖学家执行。现有的数字图谱，如艾伦脑图谱，仅限于低分辨率图像，无法识别神经元的精细结构。我们开发了一种数字图谱方法，结合了大脑三维组织信息与不同结构中神经元的详细纹理。利用该方法，我们为小鼠脑干和中脑构建了一个图谱，这两个区域目前尚无优质图谱。我们的图谱是“主动”的，因为它可用于将组织学堆栈自动对齐到图谱，从而减少神经解剖学家的工作量。
引用
@article{arxiv.1702.08606,
title = {The Active Atlas: Combining 3D Anatomical Models with Texture Detectors},
author = {Yuncong Chen and Lauren McElvain and Alex Tolpygo and Daniel Ferrante and Harvey Karten and Partha Mitra and David Kleinfeld and Yoav Freund},
journal= {arXiv preprint arXiv:1702.08606},
year = {2018}
}
备注
8 pages, 10 figures, appeared in proceeding of MICCAI 2017