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AutoAtlas:用于三维无监督分割与表示学习的神经网络

图像与视频处理 2021-11-12 v3 计算机视觉与模式识别 机器学习

摘要

我们提出了一种称为 AutoAtlas 的新型神经网络架构,用于对三维脑磁共振成像(MRI)体数据进行完全无监督的分割与表示学习。AutoAtlas 由两个神经网络组件构成:一个基于体数据局部纹理执行多标签分割的神经网络,以及一个压缩每个分割区域内所含信息的神经网络。我们通过优化一个损失函数同时训练这两个组件,该损失函数旨在促进对每个分割区域的精确重建,同时鼓励空间上平滑且连续的分割,并抑制相对较小的分割区域。我们表明,这些分割区域能够适应受试者特定的脑组织结构变异,同时在各受试者间一致地出现在相似的空间位置。AutoAtlas 还能生成表示每个分割区域局部纹理的极低维特征。我们利用所导出的特征表示演示了对每个受试者相关元数据的预测,并将结果与使用 FreeSurfer 解剖学分割所导出特征的预测进行比较。由于我们的特征与不同分割区域内在关联,我们随后可将感兴趣的值(例如分区特定的特征重要性分数)映射到大脑上进行可视化。

关键词

引用

@article{arxiv.2010.15987,
  title  = {AutoAtlas: Neural Network for 3D Unsupervised Partitioning and Representation Learning},
  author = {K. Aditya Mohan and Alan D. Kaplan},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2010.15987},
  year   = {2021}
}

备注

IEEE Journal of Biomedical and Health Informatics