蛋白质折叠核的类毛细管生长
生物大分子
2007-12-14 v1
摘要
我们利用广义的二维毛细管标度理论形式，分析了变分模型预测的 28 种双态蛋白质的折叠路径。标度指数范围从 0.2 到 0.45，平均值为 0.33。该平均值对应于刚性物体的堆积。也就是说，平均而言，发现折叠核的折叠核心相对弥散。我们还根据密度或堆积分数研究了沿折叠路径的折叠核及其界面的生长。折叠核心和界面区域的演化可根据折叠核心的生长如何与界面密度的变化相平衡而分为三种生长模式。最后，我们通过直接计算折叠核心和界面区域的堆积分数，量化了临界核的弥散结构与极化结构。我们的结果支持将蛋白质折叠描述为折叠核的类毛细管生长这一总体图景。
引用
@article{arxiv.0712.2188,
title = {Capillarity-like growth of protein folding nuclei},
author = {Xianghon Qi and John J. Portman},
journal= {arXiv preprint arXiv:0712.2188},
year = {2007}
}
备注
16 pages,6 figures. Submitted to Proc.Natl.Acad.Sci