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在“无共同机制”的框架下能否避免“统计不一致性”?

种群与进化 2009-12-02 v1 定量方法

摘要

在性状演化的“无共同机制”(NCM)模型中,每个性状都可以在系统发育树上部分或完全独立的过程下演化(例如,具有各自的分支长度)。在这种情况下,通常足以通过最大似然(ML)等方法建立树重建统计一致性的条件不再成立,这表明此类方法可能容易出现统计不一致性(SIN)。在本文中,我们探讨在采用此类模型时,是否可以通过使用 ML 或任何其他可设计的方法来避免树拓扑重建中的 SIN。我们证明,对于某些 NCM 模型可以避免 SIN,但对于其他模型则不能,并且结果在很大程度上取决于所采用的树重建方法。我们还描述了近期一些数学结果对于更常见的“共同机制”设置的生物学意义。我们的结果并非旨在为 NCM 辩护,而是为正式探讨此类问题建立一个框架。

关键词

引用

@article{arxiv.0912.0041,
  title  = {Can we avoid 'SIN' in the house of 'No Common Mechanism'?},
  author = {Mike Steel},
  journal= {arXiv preprint arXiv:0912.0041},
  year   = {2009}
}

备注

33 pages, 1 figure