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系统发育混合:大树极限下的测度集中

概率论 2012-11-30 v2 数据结构与算法 统计理论 种群与进化 统计理论

摘要

从DNA或蛋白质序列重建系统发育是计算进化生物学的一项主要任务。常见的现象,特别是跨基因组的突变率变异以及基因谱系历史之间的不一致,常常使得有必要将分子数据建模为源自系统发育的混合。此类混合模型在实践中发挥着越来越重要的作用。利用测度集中技术,我们证明了大树的混合通常是可识别的。我们还推导了实现高概率重建所需的序列长度要求。

关键词

引用

@article{arxiv.1108.3112,
  title  = {Phylogenetic mixtures: Concentration of measure in the large-tree limit},
  author = {Elchanan Mossel and Sebastien Roch},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1108.3112},
  year   = {2012}
}

备注

Published in at http://dx.doi.org/10.1214/11-AAP837 the Annals of Applied Probability (http://www.imstat.org/aap/) by the Institute of Mathematical Statistics (http://www.imstat.org)