无标度调控网络是否比随机网络更大?
基因组学
2007-05-23 v1 分子网络
摘要
编译了来自 Debian GNU/Linux 操作系统中具有调控相互作用(依赖与冲突)的软件包网络,用作基因调控网络的类比。利用回溯算法,我们分别从真实数据和零模型数据组装具有无标度与指数拓扑的网络。我们计算了系统中可功能性安装的最大软件包数(即活跃网络规模)。我们表明无标度调控网络比随机网络允许更大的活跃网络规模。具有无标度调控拓扑的小基因组可比具有指数拓扑的大基因组提供多得多的功能,这对其动力学、鲁棒性和进化有意义。
引用
@article{arxiv.q-bio/0501027,
title = {Are scale-free regulatory networks larger than random ones?},
author = {Miguel A. Fortuna and Carlos J. Melian},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0501027},
year = {2007}
}
备注
Submitted to Phys. Rev. Lett