分数稳定分布用于基因表达谱近似的应用
统计理论
2015-06-08 v1 基因组学
统计理论
摘要
目前已可靠地确立,微阵列实验的基因表达概率密度函数具有若干普遍性质。首先,这些分布具有幂律渐近性;其次,这些分布的形状对所有生物体和组织都是固有的。这一事实导致出现了许多研究各种概率分布以近似基因表达经验分布的工作。然而,所有这些分布都不是极限分布,也不是任何方程的解。我们认为这些事实是这些概率定律的本质缺陷。此外,单个基因的表达并非偶然事件,它依赖于其他基因的表达。这使得我们可以谈论细胞内存在基因调控网络。本文描述了分数稳定分布 (FSD) 类。该类分布是独立同分布随机变量之和的极限分布。这些分布具有幂律渐近性,这一事实使我们能够将其应用于近似微阵列实验的基因表达实验密度。FSD 的参数通过实验数据进行统计估计,并将经验密度与理论密度进行比较。本文提出了参数估计和 FSD 变量模拟的算法。此类比较的结果使我们得出结论:基因表达的经验密度可以用 FSD 进行近似。
引用
@article{arxiv.1406.7114,
title = {Application of the fractional stable distributions for approximation of gene expression profiles},
author = {Viacheslav Saenko and Yurij Saenko},
journal= {arXiv preprint arXiv:1406.7114},
year = {2015}
}