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基于功能数据的祖先推断：统计方法与数值示例

机器学习 2012-08-06 v1 种群与进化定量方法

作者: Pantelis Z. Hadjipantelis , Nick S. Jones , John Moriarty , David Springate , Christopher G. Knight

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摘要

许多具有进化意义的生物特征并非标量变量，而是连续函数。本文利用系统发育高斯过程回归对模拟的函数值性状的进化进行建模。给定仅来自进化树末端的函数值数据，并利用独立主成分分析 (IPCA) 作为降维方法，我们构建了祖先函数值性状的分布估计，并估计了描述其进化动态的参数。

关键词

祖先推断功能数据系统发育高斯过程回归函数值性状独立主成分分析降维进化动态

引用

@article{arxiv.1208.0628,
  title  = {Ancestral Inference from Functional Data: Statistical Methods and Numerical Examples},
  author = {Pantelis Z. Hadjipantelis and Nick S. Jones and John Moriarty and David Springate and Christopher G. Knight},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1208.0628},
  year   = {2012}
}