关于相关进化的相同推断源于祖先状态重建与独立对比
种群与进化
2013-10-02 v1
摘要
基于祖先状态重建对连续性状进化进行的推断，通常被认为比独立对比分析更容易出错。在此我们表明，这两种方法实际上为相关性状的回归系数和相关系数产生了相同的估计量，表明重建的祖先状态是关于相关进化的有效信息来源。我们证明了系统发育树上一对兄弟节点相关的独立对比，可以用这些节点及其共同父节点的最大似然祖先状态函数来表示。该表达式为任何允许局部似然函数的进化模型导出了独立对比的新公式。因此，我们推导出了适用于定向漂移下进化性状的新独立对比公式，并利用模拟数据表明，当性状确实具有定向进化趋势时，这些定向对比比标准独立对比能提供更好的进化模型参数估计。
引用
@article{arxiv.1310.0035,
title = {Identical inferences about correlated evolution arise from ancestral state reconstruction and independent contrasts},
author = {Michael G. Elliot},
journal= {arXiv preprint arXiv:1310.0035},
year = {2013}
}
备注
31 pages including supplementary information, 2 figures