基于二分网络的免疫系统实证研究
适应与自组织系统
2007-12-06 v1 细胞行为
摘要
免疫系统是抵抗人类病原体最重要的防御系统。本文提出了一种基于二分图理论的免疫模型。我们通过 COPE 数据库收集数据，构建了免疫细胞 - 介质网络。该网络的度分布被证明服从幂律，指数为 1.8。通过分析，我们发现一些高度数的介质在调节免疫活性过程中非常重要，例如 TNF-alpha、IL-8、TNF-alpha 受体、CCL5、IL-6、IL-2 受体、TNF-beta 受体、TNF-beta、IL-4 受体、IL-1 beta、CD54 等。这些介质在免疫系统中对调节其活性至关重要。我们还发现免疫系统的同配性为 -0.27，这表明我们的免疫系统是非社交网络。最后，我们发现网络的相似度为 0.13，任意两个细胞之间的相似程度较小，这表明许多细胞具有其独特的特征。结果表明，该模型能够全面地描述免疫系统。
引用
@article{arxiv.0712.0659,
title = {An Empirical Study of Immune System Based On Bipartite Network},
author = {Sheng-Rong Zou and Yu-Jing Peng and Zhong-Wei Guo and Ta Zhou and Chang-gui Gu and Da-Ren He},
journal= {arXiv preprint arXiv:0712.0659},
year = {2007}
}
备注
6 pages, 5 figures