四价 DNA 纳米星的精确相图
软凝聚态物质
2014-10-01 v1 材料科学
摘要
我们通过采用真实 DNA 粗粒化模型的分子动力学模拟，评估了四价 DNA 纳米星（即完全由 DNA 构成的纳米结构）的相行为及其结构和动力学性质。我们发现，随着系统冷却，四聚体在一个浓度区域内发生气-液相分离，如果考虑盐浓度差异，该区域与最近测量的实验相图 [S. Biffi \textit{et al}, Proc. Natl. Acad. Sci, \textbf{110}, 15633 (2013)] 具有可比性。我们还提出了一个基于成键贡献的平均场自由能来对相图进行建模，该成键贡献由 Wertheim 在其缔合液体研究中推导得出，结合了适用于 DNA 结合的质量作用定律表达式和数值评估的参考自由能。所得自由能在定性上重现了数值数据。最后，我们报告了所有研究温度和浓度下纳米星结构的信息，例如单个四聚体的几何结构和柔性以及集体行为，为未来的小角散射实验提供了有用的参考。
引用
@article{arxiv.1401.2837,
title = {Accurate phase diagram of tetravalent DNA nanostars},
author = {Lorenzo Rovigatti and Francesca Bomboi and Francesco Sciortino},
journal= {arXiv preprint arXiv:1401.2837},
year = {2014}
}
备注
10 pages, 11 figures