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DNA功能化纳米胶体相图的定量预测

软凝聚态物质 2013-05-06 v1 计算物理

摘要

我们提出了一个计算上易处理的DNA功能化胶体的粗粒化模型。重要的是,模型参数完全基于实验数据。使用这个高度简化的模型,我们可以预测DNA功能化纳米胶体的相行为,而不需要假设胶体间相互作用的成对可加性。我们的模拟表明,对于纳米胶体,成对可加性假设会导致对晶体相自由能的估计出现重大误差。我们将结果与现有实验数据进行比较,发现模拟预测了固相的正确结构,并给出了熔化温度的很好估计。目前对单链DNA序列的轮廓长度和持久长度的实验估计存在较大的不确定性。使用最佳可用估计,我们得到的晶格常数预测偏差百分之几:这表明需要更准确的ssDNA实验数据才能充分利用我们的粗粒化方法。

关键词

引用

@article{arxiv.1205.4937,
  title  = {Quantitative prediction of the phase diagram of DNA-functionalized nano-colloids},
  author = {Bianca M. Mladek and Julia Fornleitner and Francisco J. Martinez-Veracoechea and Alexandre Dawid and Daan Frenkel},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1205.4937},
  year   = {2013}
}

备注

4 pages, 2 figures; accepted for publication in Phys. Rev. Lett