凝胶化 DNA 纳米星的小角中子散射与分子动力学结构研究
生物物理
2016-09-21 v1 软凝聚态物质
摘要
具有适当设计序列的 DNA 寡聚体自组装成明确的结构。在此，我们利用该方法学生产大量四价 DNA 纳米星（每个由 196 个核苷酸组成）并探索其聚集过程的结构特征。我们报道了小角中子散射实验，聚焦于在体系形成四价平衡凝胶的纳米星浓度下，评估散射强度的形状因子与温度演化。我们还对单个孤立四聚体进行分子动力学模拟，以在无需借助任何近似形状的情况下理论评估形状因子。发现数值形状因子与实验形状因子非常吻合。模拟预测了基本与温度无关的形状因子，提供了提取有效结构因子及其在平衡凝胶化过程中演化的可能性。
引用
@article{arxiv.1605.01650,
title = {Small-angle neutron scattering and Molecular Dynamics structural study of gelling DNA nanostars},
author = {Javier Fernandez-Castanon and Francesca Bomboi and Lorenzo Rovigatti and Marco Zanatta and Alessandro Paciaroni and Lucia Comez and Lionel Porcar and Charl J. Jafta and Giulia C. Fadda and Tommaso Bellini and Francesco Sciortino},
journal= {arXiv preprint arXiv:1605.01650},
year = {2016}
}
备注
9 pages, 5 figures