生物过滤器的随机混合模型
机器学习
2013-08-27 v1 计算工程、金融与科学
分子网络
摘要
我们提出了一种生物过滤器的混合模型，这是一种遗传电路，用于消除细胞内部对外部环境表征中的快速波动。该模型采用经典的前馈环 (FFL) 模体，并将其表示为连续蛋白质浓度网络和二元、不可观测的基因启动子状态网络。我们解决了基于部分离散时间观测对此类模型进行统计推断和参数学习的问题。我们表明，混合表示法为该电路中的近似统计推断提供了一种高效算法，并在模拟数据集上展示了其有效性。
引用
@article{arxiv.1308.5338,
title = {A stochastic hybrid model of a biological filter},
author = {Andrea Ocone and Guido Sanguinetti},
journal= {arXiv preprint arXiv:1308.5338},
year = {2013}
}
备注
In Proceedings HAS 2013, arXiv:1308.4904