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基于多尺度随机反应网络混合近似的随机滤波器

统计方法学 2020-09-09 v2 最优化与控制 定量方法

摘要

我们考虑了根据荧光报告基因的时间序列测量来估计细胞内多尺度随机反应网络动态潜状态的问题。我们首先证明,通过求解一个将动态表示为混合过程的简化模型的滤波问题,可以构造出原滤波问题的精确解。该模型简化基于利用原始网络中的时间尺度分离,并且可以大大减少模拟动态所需的计算量。这使我们能够开发高效的粒子滤波器,通过将粒子滤波器应用于简化模型来求解原始模型的滤波问题。我们通过一个数值例子说明了我们方法的精度和计算效率。

关键词

引用

@article{arxiv.2008.11682,
  title  = {Stochastic filters based on hybrid approximations of multiscale stochastic reaction networks},
  author = {Zhou Fang and Ankit Gupta and Mustafa Khammash},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2008.11682},
  year   = {2020}
}

备注

6 pages, 1 figure. Accepted to CDC 2020