长聚合物的随机环模型
软凝聚态物质
2009-02-16 v3
摘要
虽然染色质在小于 30 nm 长度尺度上的结构已被详细研究,但关于间期染色质的高阶折叠基序却知之甚少。最近的实验证据表明,折叠可能局部依赖于基因密度和转录活性,并在长距离处表现出饱和现象,即近似满足 。我们提出了一种新模型,通过随机环的形成来解释这种饱和现象。我们推导了两珠之间均方位移的解析表达式,其中平均值是在固定但随机的环构型下对热系综取的,而对不同环构型系综的淬火平均(结果证明等价于对随机矩阵系综的平均)则是数值进行的。对该模型的详细研究表明,所有尺度的环对于拟合实验数据都是必要的。
引用
@article{arxiv.0705.1470,
title = {A Random Loop Model for Long Polymers},
author = {Manfred Bohn and Dieter W. Heermann and Roel van Driel},
journal= {arXiv preprint arXiv:0705.1470},
year = {2009}
}
评论
8 pages, 7 figures; major changes: added paragraph with calculation of the annealed ensemble