染色质的主动重塑及其对体内折叠的启示
生物物理
2015-10-15 v1 软凝聚态物质
统计力学
摘要
近期高分辨率实验提供了大尺度间期染色质统计性质的定量描述。这些发现刺激了寻找产生此类特定统计构象的通用物理相互作用。在此,我们展示一个基于聚合物弹性、限制、拓扑约束以及由ATP依赖的染色质重塑蛋白的(解)结合产生的主动应力之间相互作用的体内折叠主动染色质模型,产生了与这些实验一致的稳态构象。我们的结果引导我们推测,这种主动折叠产生的染色质构象通过共定位共享转录资源的基因位点优化了信息存储。
引用
@article{arxiv.1510.04157,
title = {Active remodeling of chromatin and implications for in-vivo folding},
author = {N. Ramakrishnan and Kripa Gowrishankar and Lakshmi Kuttippurathu and P. B. Sunil Kumar and Madan Rao},
journal= {arXiv preprint arXiv:1510.04157},
year = {2015}
}
备注
18pages and 4 figures in main article and 27pages of SI with 20 figures