病例对照关联研究中一种功效强大的 MAF 中性基于等位基因的检验

在旨在定位感兴趣疾病的常染色体疾病变异的病例对照研究中，标记与疾病状态之间的关联通常通过比较病例与对照的标记次要等位基因频率（MAF）来检验。对于大多数常见的基于等位基因的检验，统计功效高度依赖于这些 MAF 的实际取值，其中低 MAF 的关联标记比高 MAF 的关联标记被检出的功效更低。因此，主要基于 p 值选择标记用于后续研究的流行策略很可能优先选择高 MAF 的标记。我们提出一种不偏向高 MAF 标记的新检验，在不牺牲高 MAF 标记性能的前提下，提升了低至中等 MAF 标记的功效，因而在这方面优于大多数现有检验。我们从理论上推导了所提检验渐近功效函数的显式公式，从而可快速简便地计算相应 p 值。所提检验的性能在渐近与有限样本量设定下均与若干现有检验进行了比较。