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提高全基因组关联研究的功效:权重起到关键作用

统计理论 2007-06-13 v1 定量方法 统计理论

摘要

全基因组关联分析引发了大量讨论,讨论内容关于尽管多重检验对功效有不利影响,如何保持检出信号的功效。我们开发了一种加权多重检验步骤,便于以检验分组的形式输入先验信息。对每个组,从组内观测到的检验统计量估计一个权重。对组进行差异加权提高了在可能含信号的组中检出信号的功效。分组加权概念相对于基于先验信息的固定权重而言,其优势在于即便许多分组与信号不相关,也常带来功效的提升。由于依赖数据,该步骤对分组选择不当具有显著的鲁棒性。若有一个(或多个)组聚集了多个含信号的检验,则功效通常得以改善,而当分组完全随机时损失的功效极少。若某组内相对于显现出若干含信号检验的组无明显信号,则前一组相对于后一组被降权。若没有组显现明显信号,则权重近似相等。该步骤唯一的限制是组数相对于所执行的总检验数要小。

关键词

引用

@article{arxiv.math/0701104,
  title  = {Improving power in genome-wide association studies: weights tip the scale},
  author = {Kathryn Roeder and Bernie Devlin and Larry Wasserman},
  journal= {arXiv preprint arXiv:math/0701104},
  year   = {2007}
}