一种新型合成抗菌肽的分子动力学与圆二色性研究
生物大分子
2015-06-12 v1
摘要
抗菌肽是一类小的、通常带正电的两亲性肽，被先天免疫系统用于在多细胞真核生物中对抗细菌感染。抗菌肽以其广谱抗菌活性而闻名，因此可作为开发针对多重耐药细菌的新型抗生素的基础。在将抗菌肽应用于治疗的过程中，最具挑战性的任务是合理设计具有增强活性且降低毒性的新型肽。在此，我们报告了对一种新型合成抗菌肽 D51 的分子动力学与圆二色性研究。该肽早先由 Loose 等人利用自然抗菌肽的语言学模型设计。在显式溶剂中肽折叠的分子动力学模拟显示了由 beta 转角连接的两条反平行 beta 链的快速形成，这一结果得到了圆二色性测量的证实。本文分析了模拟得到的肽的两亲性构象，并提出了其与细菌膜相互作用的可能机制以及增强其抗菌活性的途径。
引用
@article{arxiv.1301.3761,
title = {A molecular dynamics and circular dichroism study of a novel synthetic antimicrobial peptide},
author = {Natalia P. Rodina and Anna N. Yudenko and Ivan N. Terterov and Igor E. Eliseev},
journal= {arXiv preprint arXiv:1301.3761},
year = {2015}
}
备注
Proceedings of Conference on physics and astronomy of the young scientists of St Petersburg (PhysicA.SPb), Russia