组蛋白等温线的长度动力学Tonks气体理论
软凝聚态物质
2015-06-24 v1 统计力学
生物大分子
摘要
我们找到了一个新的二维(1D)相互作用粒子理论的精确解,并将结果应用于聚合物(如DNA)在蛋白质颗粒(如组蛋白)周围的吸附和缠绕。每个吸附的蛋白质被表示为一个Tonks气体粒子。每个粒子的长度是一个自由度,代表DNA在每个组蛋白周围的缠绕程度。热力学量作为缠绕能量、吸附组蛋白密度和体相组蛋白浓度(或化学势)的函数进行计算;还讨论了它们的实验特征。发现组蛋白密度作为化学势的函数经历了一个两阶段吸附过程,而高亲和力蛋白质的平均覆盖率作为化学势的函数表现出最大值。然而,覆盖率的涨落同时达到最大。还计算了组蛋白-组蛋白关联函数,表现出丰富的双长度尺度行为。
关键词
引用
@article{arxiv.cond-mat/0212431,
title = {A length-dynamic Tonks gas theory of histone isotherms},
author = {Tom Chou},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0212431},
year = {2015}
}
备注
5 pp, 3 figs