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通过时间重标度刻画重构出生死亡过程

种群与进化 2020-05-07 v2 概率论

摘要

呈现指数增长的种群动态可建模为出生死亡过程,该过程自然地捕捉了种群规模随时间的随机变化。在本文中,我们考虑一个超临界出生死亡过程,其在过去某一随机时刻启动,并条件于在当前有 nn 个被抽样个体。在当前时刻抽样的个体的系谱由反向重构过程(RRP)描述,该过程从当前时刻向后追踪样本祖先。我们表明,对 RRP 进行简单的解析时间重标度,提供了一种推导其事件间隔时间的直接方法。同样的重标度刻画了该过程背后的其他分布,这些分布在文献中通过更繁琐的计算获得。我们还考虑了种群不完全抽样的情况,其中系谱的每个叶节点以独立的伯努利试验以概率 ψ\psi 保留,并表明使用时间重标度可推导伯努利抽样 RRP 的相应结果,适用于底层参数的任意取值。一个核心结果是利用时间重标度形式推导了当 ψ\psi 趋近于 0(对应于底层种群增长至无穷)时的标度极限。我们表明,在此设定下,经过线性时间重标度后,事件时间为 nn 个逻辑斯谛随机变量的顺序统计量,其众数为 log(1/ψ)\log(1/\psi);此外,我们表明事件间隔时间近似服从指数分布。

关键词

引用

@article{arxiv.1912.04861,
  title  = {A characterisation of the reconstructed birth-death process through time rescaling},
  author = {Anastasia Ignatieva and Jotun Hein and Paul A. Jenkins},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1912.04861},
  year   = {2020}
}

备注

32 pages, 5 figures