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XNAT-PIC:将XNAT扩展至临床前成像中心

定量方法 2021-03-04 v1 图像与视频处理

摘要

分子成像产生大量异构的生物医学图像,迫切需要对图像数据处理制定指南。尽管针对人类流行病学研究已实现了若干成功的解决方案,但针对动物群体研究提出的方法寥寥且有限。临床前成像研究涉及多种设备并产生大量原始数据,而当前存储和分发图像数据的做法尚不充分。因此,需要建立用于分析大型图像数据集的标准工具。在本文中,我们提出了面向临床前成像中心的XNAT扩展(XNAT-PIC)。XNAT是一个全球使用、开源的平台,用于安全地托管、共享和处理临床成像研究。尽管取得了成功,XNAT中既无用于导入大型多模态临床前图像数据集的工具,也无用于处理整个成像研究的流程。为克服这些局限,我们开发了若干工具以扩展XNAT核心功能,从而支持临床前成像设施。我们的目标是在临床前成像界简化图像数据的管理与交换,进而提升图像处理结果的可重复性并推动开放科学实践。

关键词

引用

@article{arxiv.2103.02044,
  title  = {XNAT-PIC: Extending XNAT to Preclinical Imaging Centers},
  author = {Sara Zullino and Alessandro Paglialonga and Walter Dastrù and Dario Livio Longo and Silvio Aime},
  journal= {arXiv preprint arXiv:2103.02044},
  year   = {2021}
}