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PyXNAT:Python 中的 XNAT

数据库 2013-01-30 v1 计算机视觉与模式识别 定量方法

摘要

随着神经影像数据库的规模和复杂性不断增长,研究人员用于调查和管理数据的时间增加,从而挤占了数据分析的时间。因此,调查人员越来越依赖使用高级语言进行脚本编写,以自动化数据管理和处理任务。为此,需要对数据存储进行结构化且可编程的访问。Web 服务是迈向这一目标的第一步。然而,由于它们仅提供数据库的底层接口,因此在功能和易用性方面有所欠缺。我们在此介绍 PyXNAT,这是一个 Python 模块,可通过原生 Python 调用在多个操作系统上与可扩展神经影像归档工具包(XNAT)进行交互。选择 Python 使得 PyXNAT 能够暴露 XNAT Web Services,并将其功能与更高级、更具表现力的语言统一起来。PyXNAT 为 XNAT 用户提供了直接访问 Python 中所有科学包的途径。最后,PyXNAT 旨在既高效又易用,既可用作构建 XNAT 客户端的后端库,也可用作命令行的替代前端。

关键词

引用

@article{arxiv.1301.6952,
  title  = {PyXNAT: XNAT in Python},
  author = {Yannick Schwartz and Alexis Barbot and Benjamin Thyreau and Vincent Frouin and Gaël Varoquaux and Aditya Siram and Daniel Marcus and Jean-Baptiste Poline},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1301.6952},
  year   = {2013}
}