细胞外电位虚拟电极记录工具 (VERTEX):比较模拟与生物哺乳动物皮层组织的多电极记录
神经元与认知
2014-09-19 v1 人工智能
神经与进化计算
摘要
使用细胞外电极采样的局部场电位 (LFPs) 常被用作群体神经元活动的度量。然而,将此类测量与潜在的神经元行为和连通性联系起来并非易事。为了帮助研究这一联系,我们开发了细胞外电位虚拟电极记录工具 (VERTEX)。我们首先确定了一个简化神经元模型,该模型保留了新皮层神经元细胞外电位的空间和频率滤波特性。随后,我们将 VERTEX 开发为一个易于使用的 Matlab 工具,用于模拟来自大规模群体(>100,000 个神经元)的 LFPs。基于 VERTEX 的模拟成功复现了猕猴新皮层组织体外多电极阵列记录的 LFPs 特征。我们的模型允许在 3D 空间中任意位置放置虚拟电极,从而可与体外记录设置进行直接比较。我们设想 VERTEX 将激励实验学家、临床医生和计算神经科学家利用模型来理解健康和疾病状态下测得的大脑动力学背后的机制。
引用
@article{arxiv.1409.5326,
title = {Virtual Electrode Recording Tool for EXtracellular potentials (VERTEX): Comparing multi-electrode recordings from simulated and biological mammalian cortical tissue},
author = {Richard J. Tomsett and Matt Ainsworth and Alexander Thiele and Mehdi Sanayei and Xing Chen and Alwin Gieselmann and Miles A. Whittington and Mark O. Cunningham and Marcus Kaiser},
journal= {arXiv preprint arXiv:1409.5326},
year = {2014}
}
备注
appears in Brain Struct Funct 2014