ViralFP:病毒融合蛋白网络服务器
定量方法
2021-06-25 v3 生物大分子
摘要
病毒融合蛋白附着于包膜病毒(包括冠状病毒、登革病毒、HIV 与流感病毒等类群)的膜上,并催化病毒与宿主膜之间的融合,使病毒能够将其遗传物质插入宿主细胞。鉴于这些生物分子的重要性,本工作提出一个集中式数据库,包含关于病毒融合蛋白的最相关信息,可通过免费使用的网络服务器访问,网址为 https://viralfp.bio.di.uminho.pt/。该网络应用包含若干生物信息学工具,如 Clustal 序列比对与 Weblogo,还包括一个基于机器学习的工具,能够在融合蛋白序列中预测融合肽(插入宿主细胞膜的融合蛋白组分)的位置。鉴于这些蛋白质在病毒感染中的关键作用、其作为免疫系统天然靶点的重要性以及作为治疗靶点的潜力,该网络应用旨在提升我们抗击致病病毒的能力。
引用
@article{arxiv.2103.14754,
title = {ViralFP: A webserver of viral fusion proteins},
author = {Pedro Moreira and Ana Marta Sequeira and Sara Pereira and Rúben Rodrigues and Miguel Rocha and Diana Lousa},
journal= {arXiv preprint arXiv:2103.14754},
year = {2021}
}