大肠杆菌SOS反应中的UV诱导突变发生：一个定量模型
分子网络
2007-05-23 v1 其他凝聚态物理
摘要
大肠杆菌通过称为SOS反应的高度协调的一系列事件来响应DNA损伤，该反应受转录因子、蛋白质-蛋白质结合和活性蛋白质降解调控。我们提出UV诱导SOS反应的动力学模型，纳入了由易错聚合酶Pol V引起的突变发生。在我们的模型中，突变发生依赖于两个关键过程的组合：复制叉的损伤计数以及与UmuD'积累相关的长期记忆。二者共同提供了我们所示导致Pol V“数字式”开启和关闭的严密突变调控。我们的模型紧凑地展现了SOS网络拓扑与设计，指出了各调控过程的具体功能角色。特别地，我们提出最近观察到的SOS调节子启动子活性中第二峰（Friedman et al., 2005, PLoS Biol. 3, e238）是Pol V到RecA丝的正反馈结果。
引用
@article{arxiv.q-bio/0701013,
title = {UV-induced mutagenesis in Escherichia coli SOS response: A quantitative model},
author = {Sandeep Krishna and Sergei Maslov and Kim Sneppen},
journal= {arXiv preprint arXiv:q-bio/0701013},
year = {2007}
}
备注
21 pages, 10 figures