大肠杆菌条件性pH应激响应系统的诱导动力学
分子网络
2010-09-17 v1
摘要
对微生物应激响应系统的分析可以揭示调控控制和适应的分子策略。本文聚焦于Cad模块，这是大肠杆菌酸性应激响应的一个子系统，仅在低pH且赖氨酸可用时条件性激活。当表达时，Cad系统通过消耗H+将赖氨酸转化为尸胺，并输出尸胺以交换外部赖氨酸，从而对抗升高的H+浓度。令人惊讶的是，即使诱导条件持续存在，cad操纵子仍表现出瞬时响应。为了定量表征Cad模块的调控，我们实验记录并理论模拟了重要系统变量的动力学。我们建立了一个定量模型，该模型能够充分描述和预测不同初始条件下的瞬时表达行为。我们对Cad系统的定量分析支持外部尸胺的负反馈是瞬时响应的起源。此外，该分析对通过调控蛋白CadC进行信号转导的精确机制施加了因果约束。
引用
@article{arxiv.1009.3155,
title = {Induction kinetics of a conditional pH stress response system in Escherichia coli},
author = {Georg Fritz and Christiane Koller and Korinna Burdack and Larissa Tetsch and Ina Haneburger and Kirsten Jung and Ulrich Gerland},
journal= {arXiv preprint arXiv:1009.3155},
year = {2010}
}
备注
13 pages, 8 figures, supplementary material available upon request from the authors