噬菌 lambda 中的稳定性之谜
软凝聚态物质
2007-05-23 v1 统计力学
q-bio
摘要
噬菌 lambda 的终 dormancy 维持开关是分子水平上计算、指挥与控制的最简单实例之一。如果在感染大肠杆菌 E. coli 后、病毒进入 dormancy 途径，它将抑制其发育功能，并将其 DNA 整合到宿主染色体中。在此状态下、该 dormant 病毒可能在许多 E. coli 代谢中被被动复制。事实上、这种抑制状态比编码于 repressor 的基因更稳定。我们发展了一种数学形式化方法来预测此类表观遗传状态的稳定性——该方法基于分子组件的亲和力。我们将该模型应用于最近发表的 lambda 右侧算子复合物突变体，并发现所报告的稳定性表明当前关于开关的观点不完整。此处描述的ethods 应该适用于表达状态的稳定性。
引用
@article{arxiv.cond-mat/0010286,
title = {Stability Puzzles in Phage Lambda},
author = {Erik Aurell and Stanley Brown and Johan Johanson and Kim Sneppen},
journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0010286},
year = {2007}
}
备注
LaTeX 24 pages, 7 figures in PostScript