肠杆菌Lambda噬菌体溶源-溶裂转变的孤子与物理机制

Andrei Krokhotine; Antti J. Niemi

肠杆菌Lambda噬菌体溶源-溶裂转变的孤子与物理机制

生物大分子 2011-04-13 v1 软凝聚态物质生物物理

作者: Andrei Krokhotine , Antti J. Niemi

摘要

Lambda噬菌体是典型的温和噬菌体。其溶源和溶裂生命周期反映了DNA结合蛋白CI与CRO之间的竞争。在此，我们通过能量函数来探讨这一转变的物理机制，该能量函数将主链描绘为多孤子构型。单个孤子的精度远远超出了实验测定蛋白质构象的B因子精度，这使我们确信四个环中有三个各自是两个位置相近的孤子的复合体。唯一的例外是抑制性DNA结合转角，它是主链中唯一的单孤子构型。当我们将孤子与蛋白质数据库进行比较时，发现DNA识别螺旋之前的那个孤子是CI蛋白所独有的，这促使我们得出结论：溶源到溶裂的转变是由于涉及孤子-反孤子湮灭的鞍结分岔，该湮灭移除了第一个环。

关键词

Lambda噬菌体溶源-溶裂转变孤子鞍结分岔蛋白质构象 CI与CRO蛋白

引用

@article{arxiv.1104.2252,
  title  = {Solitons and Physics of the Lysogenic to Lytic Transition in Enterobacteria Lambda Phage},
  author = {Andrei Krokhotine and Antti J. Niemi},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1104.2252},
  year   = {2011}
}

备注

5 pages 3 figures

肠杆菌Lambda噬菌体溶源-溶裂转变的孤子与物理机制

摘要

关键词

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