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噬菌体内 DNA 的统计特性与动力学

软凝聚态物质 2007-05-23 v1 q-bio

摘要

讨论了关于线性 DNA 在噬菌体和球状体中的包装的若干争议性问题。依据假设 DNA 球状体具有均匀密度,推导了渗透压、囊内压和装载力的精确关系,公式中包含囊内孔隙大小。引入一种新的静电模型用于计算高浓度细长聚电聚合物的渗透压。在中等包装下,考虑了 DNA 在环形球状体内扩散的复合模型。在紧密包装条件下,提出了库仑滑动摩擦模型。对我们对囊内 DNA 统计特性与动力学的当前理解作了总体讨论,涉及液晶相的表征、噬菌体的 X 射线散射、渗透压应力测量、球状体内的环化以及单分子装载力测定等实验。

关键词

引用

@article{arxiv.cond-mat/0305354,
  title  = {Statics and Dynamics of Condensed DNA within Phages and Globules},
  author = {Theo Odijk},
  journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/0305354},
  year   = {2007}
}

备注

32 pages, 5 figures, submitted to Phil.Trans.Roy.Soc.A ; special issue entitled "Mechanics of DNA", editor J.M.T.Thompson