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由 Davidov 脉冲子介导的蛋白质构象变换与折叠

凝聚态物理 2007-05-23 v1 q-bio

摘要

我们指出,Davidov 脉冲子通过蛋白质主链可介导构象转换及蛋白质折叠至其天然构象。本文给出一个简单模型,其中非线性 Schrodinger (NLS) 场与另一个场 phi 相互作用,后者对应蛋白质构象角度。该相互作用为构象场提供克服折叠能垒所需的能量,从而无需随机热活化。因此,这种转换是确定性的受控过程。脉冲子因折叠过程中获得的能量而补偿其能量损失。即使存在施加的无序,只要脉冲子初始动量足够大,这一情景也不会发生显著变化。

关键词

引用

@article{arxiv.cond-mat/9911004,
  title  = {Conformation changes and folding of proteins mediated by Davidov's soliton},
  author = {Shay Caspi and Eshel Ben-Jacob},
  journal= {arXiv preprint arXiv:cond-mat/9911004},
  year   = {2007}
}

备注

14 pages, 2 figures