红鳍东方鲀（河豚）基因组中 DNA 碱基 CG 频率分布的普适谱
综合物理
2011-03-07 v2 生物物理
摘要
DNA 碱基 A、C、G、T 的频率分布表现出自然界动力系统普遍存在的分形涨落。分形涨落的功率谱呈现逆幂律形式，标志着局部（小尺度）与全局（大尺度）扰动之间存在长程关联。作者基于经典统计物理发展了一种针对分形涨落的广义系统理论，该理论预测分形涨落的涡旋振幅概率分布与方差（涡旋振幅的平方）谱遵循以黄金分割率表示的普适 Boltzmann 逆幂律。模型预测的分布在均值两个标准差内的涨落非常接近统计正态分布，并表现出肥长尾。本文表明，红鳍东方鲀（河豚）基因组 Release 4 中的 DNA 碱基 CG 频率分布表现出与模型预测一致的普适逆幂律形式。在 DNA 碱基中观测到的长程关联意味着，看似冗余的非编码“垃圾”或“自私”DNA 也可能对蛋白质编码 DNA 的高效功能产生贡献，这一结果得到了近期研究的支持。
引用
@article{arxiv.0704.2114,
title = {Universal spectrum for DNA base CG frequency distribution in Takifugu rubripes (Puffer fish) genome},
author = {A. M. Selvam},
journal= {arXiv preprint arXiv:0704.2114},
year = {2011}
}
备注
32 pages, 8 figures