原核生物中遗传转移的单元
基因组学
2008-01-29 v2 种群与进化
摘要
遗传物质在物种之间的转移（水平基因转移，LGT）有助于原核生物的基因组和生理学创新。已有若干研究考察了原核生物中LGT的程度，但转移单元尚未得到严格的研究。利用严格的系统发育方法，我们分析了来自144个完整测序的原核生物基因组中单拷贝基因家族内的LGT单元。这些基因家族中共有30.3%显示出LGT的证据。我们发现基因片段的转移比完整基因的转移更为频繁，暗示LGT的程度被低估了。我们发现在基因内（片段性）转移与全基因（非片段性）转移之间功能偏差很小，但非片段性转移进入致病菌比进入非致病菌更为频繁。由于包含可能旁系同源基因的基因家族被排除在当前研究之外，我们的结果可能仍低估了LGT的程度；然而这是迄今为止对原核生物基因组中LGT单元最为全面的研究。
引用
@article{arxiv.0709.2027,
title = {Units of genetic transfer in prokaryotes},
author = {Cheong Xin Chan and Robert G. Beiko and Mark A. Ragan},
journal= {arXiv preprint arXiv:0709.2027},
year = {2008}
}
备注
22 pages, 5 figures, 1 table