蛋白质结构域作为遗传转移单元
基因组学
2008-01-29 v2 种群与进化
摘要
基因组以模块形式演化。在原核生物(及部分真核生物)中,遗传物质可通过同源或非法重组在不同物种间转移并整合至基因组中。几乎没有理由认为转移单元对应于完整基因;然而,此类单元尚未得到严格表征。我们检查了来自 144 个原核生物基因组的单拷贝基因家族中的片段化遗传转移,发现断裂点显著比随机预期更靠近编码蛋白质注释结构域的基因组区域边界,尤其是在重组序列分歧度较高时。这种相关性源于重组事件本身,而非核苷酸替换的差异。我们报告了首项将遗传重组与蛋白质水平结构特征相关联的系统性研究。
引用
@article{arxiv.0709.2030,
title = {Protein domains as units of genetic transfer},
author = {Cheong Xin Chan and Robert G. Beiko and Aaron E. Darling and Mark A. Ragan},
journal= {arXiv preprint arXiv:0709.2030},
year = {2008}
}
备注
11 pages, 4 figures, 1 table