DomainScope：基于蛋白质结构域连接的疾病网络
基因组学
2019-11-21 v1
摘要
蛋白质结构域是高度保守的蛋白质功能单元。由于它们携带功能上重要的信息，大多数编码疾病变异位于结构域上。此外，结构域是蛋白质中可用于药物递送靶向的特定单元。在此，利用与疾病相关的变异位点信息，基于疾病共享同一结构域及结构域变异位点构建了一个疾病网络。结果是49,990对由结构域变异位点连接的疾病对，以及533,687对共享同一突变结构域的疾病对。将这些疾病对与使用先前方法（如基因同一性和基因变异位点同一性）构建的疾病对进行比较，揭示其中超过8,000对不仅缺失于基因配对中，而且在文献中也未常见共同出现。从疾病主题类别对该疾病网络进行分析，与基于基因的疾病网络比较显示，结构域方法导致跨疾病类别的连接数多于疾病类别内的连接数。进一步，对该基于结构域创建的疾病网络的药品重定位可能性研究表明，16,902对疾病对中有一方疾病有报告药物而另一方没有，突出了这一新方法的药物重定位潜力。
引用
@article{arxiv.1911.08676,
title = {DomainScope: A disease network based on protein domain connections},
author = {Alin Voskanian-Kordi and Ashley Funai and Maricel G. Kann},
journal= {arXiv preprint arXiv:1911.08676},
year = {2019}
}