临床试验难题：网络效应如何限制药物发现

后基因组医学所提供的深度知识承载着新药物及多种疾病治愈方法的承诺。为探究这一能力在多大程度上已成为现实，我们从跨越四十年的356,403项临床试验中提取元数据，旨在对药物发现中的创新实践提供机制性见解。我们发现因循守旧主导了创新，因为超过96%的已记录试验聚焦于先前测试过的药物靶点，且所测试药物仅靶向人类互作组的12%。若当前模式持续，靶向所有可成药蛋白将需要170年。我们揭示了当前限制靶点发现的两个基于网络的根本机制：优先连接，导致对先前已靶向蛋白的重复探索；以及局部网络效应，将探索限制在与高度探索蛋白相互作用的蛋白上。我们基于这些见解构建了药物发现的定量基于网络的模型。我们证明该模型能够准确重建临床试验中观察到的探索模式。最为重要的是，我们表明基于网络的搜索策略可通过将探索引导至人类互作组中未充分探索区域中的新型蛋白，来拓宽药物发现的范围。