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超慢水介导的跨膜相互作用调控 A$_{\text{2A}}$ 腺苷受体的激活

生物大分子 2017-01-04 v1

摘要

G 蛋白偶联受体内部的水分子最近在一系列晶体结构中受到关注。为了解析内部水分子在 GPCR 活性中的动力学和功能作用,我们利用 μ\musec 分子动力学模拟研究了 A2A_{\text{2A}} 腺苷受体。我们的研究发现,跨膜 (TM) 结构域的水通量随受体状态而变化,且活性态下 TM 通道中的水分子流速比非活性态慢三倍。取决于溶剂 - 蛋白质界面的位置以及受体状态,每个残基处水的平均停留时间从 O(102)\sim\mathcal{O}(10^2) psec 变化到 O(102)\sim\mathcal{O}(10^2) nsec。特别是,在活性态中表现出超慢弛豫 (O(102)\sim\mathcal{O}(10^2) nsec) 的水分子被发现围绕在微开关残基周围,这些残基被认为是 GPCR 功能的活性热点。由水介导接触产生的跨越 TM 结构域的连续变构网络是活性态所独有的,突显了慢速水分子在 GPCR 激活中的重要性。

关键词

引用

@article{arxiv.1608.01473,
  title  = {Ultraslow water-mediated transmembrane interactions regulate the activation of A$_{\text{2A}}$ adenosine receptor},
  author = {Yoonji Lee and Songmi Kim and Sun Choi and Changbong Hyeon},
  journal= {arXiv preprint arXiv:1608.01473},
  year   = {2017}
}

备注

21 pages, 14 figures