调控二维连锁 DNA 网络的拓扑结构
软凝聚态物质
2022-09-13 v1 统计力学
摘要
聚合物的分子拓扑在决定其物理性质方面起着关键作用。我们在此研究了称为动质体（kinetoplast）的二维 DNA 环连锁网络的静态和动态性质中的拓扑效应。限制性内切酶可在特定序列位点切割 DNA，被用来选择性地切割并移除网络中的环，从而在保持整体结构完整性的同时调控分子拓扑。我们发现拓扑对二维网络的空间伸展影响甚微，却显著影响其弛豫行为。网络的形状涨落由归属于网络热涨落和受限的两个不同特征时间尺度支配。热弛豫时间常数与各向异性涨落振幅之间的关系给出一种普适标度。有趣的是，该标度独立于连锁网络内环的具体排布和/或穿孔情况。本研究提供了一种通过理性且高度可控地修改底层拓扑来调控二维连锁 DNA 网络弹性性质的方法。
引用
@article{arxiv.2209.04486,
title = {Tuning the Topology of a Two-Dimensional Catenated DNA Network},
author = {Indresh Yadav and Dana Al Sulaiman and Patrick S. Doyle},
journal= {arXiv preprint arXiv:2209.04486},
year = {2022}
}
备注
4+ pages, 4 figures